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La surveillance des IRA a pour objectif le suivi des épidémies de grippe, de COVID-19 ainsi que celles dues aux autres virus respiratoires saisonniers (VRS, rhinovirus et métapneumovirus).

En France métropolitaine, la semaine dernière (2021s46), le taux d'incidence des cas d'infection respiratoire aiguë (IRA) vus en consultation (ou en téléconsultation) de médecine générale a été estimé à 142 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [127 ; 157]). Ce taux est en nette augmentation par rapport à la semaine 2021s45 (données consolidées : 91 [81 ; 101]).

Au niveau régional, les taux d'incidence les plus élevés ont été observés en : Provence-Alpes-Côte d'Azur (268 [161 ; 375]), Grand Est (189 [120 ; 258]) et Occitanie (177 [128 ; 226]).

Surveillance de la COVID-19 : La semaine dernière (2021s46), le taux de positivité au SARS-CoV-2 des patients consultant pour une IRA était de 6%, 20% et 7%, respectivement chez les 0-14, 15-64 et 65 ans et plus. Ces estimations sont en augmentation chez les 0-14 et 15-64 ans.
Le taux d'incidence des IRA dues au SARS-CoV-2 (COVID-19) vues en consultation de médecine générale a été estimé à 22 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [17 ; 26]), ce qui représente 14 235 [11 011 ; 17 459] nouveaux cas de COVID-19 ayant consulté un médecin généraliste.

Surveillance de la grippe : six prélèvements ont été testés positifs pour un virus grippal de type A depuis la reprise de la surveillance. Il s'agissait de quatre cas non sous-typés : deux isolés en semaines 38 (mi-septembre) et deux en semaine 46 (mi-novembre), d'un cas de grippe A(H1N1)pdm09 isolé en semaine 42 (mi-octobre), et d'un cas de grippe A(H3N2) isolé en semaine 45 (mi-novembre).

Surveillance des autres virus respiratoires : circulation des VRS, métapneumovirus et rhinovirus observée en semaine 2021s46.

 
La surveillance des diarrhées aiguës a pour objectif le suivi des épidémies de gastro-entérites.
En France métropolitaine, la semaine dernière (2021s46), le taux d'incidence des cas de diarrhée aiguë vus en consultation de médecine générale a été estimé à 122 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [107 ; 137]). Ce taux est en augmentation par rapport à la semaine 2021s45 (données consolidées : 99 [88 ; 110]) et est à un niveau d'activité inférieur à ceux observés habituellement en cette période.

Au niveau régional, les taux d'incidence les plus élevés ont été observés en : Hauts-de-France (180 [70 ; 290]), Provence-Alpes-Côte d'Azur (165 [78 ; 252]) et Normandie (150 [0 ; 315]).